Kebun Batikan terletak di sebelah utara makam Wijaya Brata dengan luas sekitar 500 m². Kebun ini berfungsi sebagai praktikum dari mata kuliah, budidaya tanaman pangan, fisiologi tanaman, pemuliaan tanaman, POPT, ilmu gulma, budidaya tanaman obat, pertanian terpadu berkelanjutan, mikrobiologi industri dan mekanisasi pertanian. 

Lokasi kebun praktik: Kebun Praktik FP UST

Fakultas Pertanian telah melaksanakan kerja sama dengan organisasi non profit Ecotica dari Belgia. Kebun Ecotica ini terletak Jl. Karangsari, Jetak, Sendangtirto, Kec. Berbah, Kabupaten Sleman dengan luas sekitar 1300 m². Kebun ini dapat digunakan untuk praktikum dari beberapa mata kuliah wajib dan pilihan. Selain digunakan untuk praktikum kebun ini juga dapat digunakan untuk penelitian mahasiswa. 

Lokasi kebun praktik: Kebun Ecotica

Fakultas Pertanian juga memiliki kebun produksi di Kaliurang Barat, Kecamatan Pakem, Kabupaten Sleman dengan luas sekitar 5000 m². Kebun ini digunakan sebagai kebun produksi minyak kayu putih. 

Lokasi kebun praktik: Kebun Kayu Putih